La ejecución de WAVES en Colombia se ha realizado en dos fases: Preparación (Fase I) e implementación (Fase II). La Fase I consistió en la configuración del proyecto, establecimiento de los Comités Directivo y Técnico, definición de las competencias y roles de los actores involucrados, definición de prioridades de política pública y objetivos principales del plan de trabajo para la fase de implementación, así como la ejecución de estudios de caso para la cuenta del agua en la Cuenca del Lago de Tota y de bosque a nivel nacional.
La Fase II (Julio 2014- junio 2016) consiste en implementar el plan de trabajo y la construcción de las cuentas de capital natural que comprende dos componentes: uno técnico y otro de política pública.
Comité Directivo
El Comité Directivo actúa como un órgano que recomienda, define y aprueba los lineamientos y enfoques de la implementación de la iniciativa. Además establece y orienta las prioridades de política pública y realiza la revisión y aprobación de la nota de política, plan de trabajo y sus actualizaciones.
Las instituciones que conforman el Comité Directivo de la iniciativa WAVES en Colombia son el Departamento Administrativo Nacional de Estadística -DANE, Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible -MADS, Instituto de Hidrología, Meteorología y Estudios Ambientales -IDEAM, Contraloría General de la República -CGR y el Departamento Nacional de Planeación –DNP, quien actúa como punto focal y algunas de sus funciones corresponden a coordinar y articular la implementación de la iniciativa, promoviendo la participación activa de todas las instituciones clave y acogiendo el acompañamiento técnico del Banco Mundial.